Auditi käigus leiti, et siseauditi metoodika võimaldab tõhusalt kontrollida hüvitiste väljamaksmise õigsust. See annab piisava kindluse, et Eesti Haigekassa maksab hüvitisi valdavas osas sihipäraselt.
Ettepanekuid ja märkusi oli Riigikontrollil liiklusõnnetusega põhjustatud isikukahju maksmise kohta, kuna selle üle sisekontroll praegu haigekassas puudub. Haigekassa teatas, et selline kontroll viiakse sisse pärast liikluskahjude maksmise koondamist ühtsesse struktuuriüksusesse. Teised ettepanekud võttis Haigekassa arvesse juba auditi käigus.