Kui märkused välja arvata, on Riigikontroll seisukohal, et ülejäänud osas on Riigikantselei 2003. aasta raamatupidamise aastaaruanne olulises osas kooskõlas rahandusministri määrusega "2003. a majandusaasta aruande koostamine, esitamine ja kinnitamine". Riigikantselei majandustehinguid hindas Riigikontroll olulises osas õigusaktidele vastavaks. Aruande õigsust mittemõjutavatest, kuid seadusega kooskõlas mitteolevatest tehingutest on kirjutatud Riigikontrolli kodulehel avaldatud aruandes.
Seoses läbiviidud auditiga märgib Riigikontroll, et kaheldav on väga paljude riigi halduses olevate külalismajade vajalikkus, sest nende hoonete osa põhitegevuses ei ole märkimisväärne ning hoone haldamisel tehtavad kulutused ei ole majanduslikult põhjendatud. Riigikontrolli arvates piisaks riigil mõnest külalismajast. Praegu on Riigikantseleil viis sellist hoonet ning need toovad kantseleile aastas 1,5 miljonit krooni kahjumit. Samas on Riigikantseleil pooleli veel ühe külalistemaja ehitamine. Nende hoonete puhul tuleks Riigikontrolli arvates otstarbekusest lähtudes otsustada hoone tulevik - võõrandada, anda üle Riigi Kinnisvara AS-ile vms. Riigivara haldamisega seotud küsimusena selgus auditi käigus ka, et Riigikantselei on rentinud oma töötajatele kortereid tasuta või väga väikese üüriga, mis ei ole kooskõlas riigivaraseadusega.
Riigikantselei audit on üks 34st sel aastal Riigikontrolli läbiviidavast riigiasutuse aastaaruande auditist. Kõik aruanded avaldatakse pärast valmimist Riigikontrolli kodulehel.